研究员，博士生导师，中国科学院高层次人才计划（BR-B）入选者。2018年博士毕业于华中农业大学农业微生物国家重点实验室，同年入选第三届“中国博士后创新人才支持计划”。2022年完成博士后研究后，入职上海交通大学医学院，任副研究员、课题组长（PI）。2025年3月加入中国科学院广州生物医药与健康研究院，任谱系技术与装备研究中心基因组多维技术研究组组长（PI）。主持国家级及省部级科研项目多项，并作为主要完成人，获教育部自然科学奖二等奖。

1）主要研究方向：

肿瘤基因组学、三维基因组学、基因组结构变异与转录调控、单细胞多组学技术开发。

2）课题组简介：

课题组长期致力于基因组学技术的源头创新，聚焦肿瘤基因组学、三维基因组学、结构变异与单细胞多组学等方向，旨在解析基因组高阶构象与功能调控的底层规律，并推动其在疾病早筛、精准诊断及治疗靶点发现中的临床实际应用。

针对基因组研究中长期存在的“结构变异难以精准捕获”以及“空间三维构象解析通量受限”等核心瓶颈，团队自主建立了一套多维染色质构象与结构变异协同捕获技术体系，在提升检测分辨率与通量的同时显著降低成本。代表性成果包括：可在循环肿瘤单细胞中同步解析基因组结构异常与三维染色质构象的Uni-C技术（Nature Communications, 2025）；适用于肿瘤及遗传病高灵敏筛查的MGA-Seq（Genome Biology, 2023）；支持高通量单细胞三维结构解析的sciDLO Hi-C（Nature Communications, 2022）；以及实现低起始量、大群体三维基因组解析的DLO Hi-C（Nature Genetics, 2018）。其中，DLO Hi-C因其“巧妙的文库构建策略”获Nature Genetics专文评述，并被Nature、Nature Genetics等期刊广泛引用。

基于此，我们系统鉴定了肿瘤及遗传性疾病中的新型结构变异，为肿瘤早期诊断标志物的开发提供了新靶点；并结合新抗原预测，为个性化肿瘤免疫治疗策略的制定提供了理论依据；深入解析了染色体外DNA（ecDNA）的空间组织特征及其转录调控机制，有望为靶向ecDNA的肿瘤治疗药物研发提供新思路。此外，课题组提出了“染色质有序性”概念，并结合全基因组关联分析数据，系统挖掘感染性疾病的遗传易感位点及潜在干预靶点。这些研究不仅深化了对疾病机制的理解，也为复杂疾病的精准医学策略制定提供了可直接转化的技术支撑与理论依据。

1） 中国科学院，择优支持项目（BR-B），2026-01-01至 2029-12-31，400万元，在研，主持

2） 人类细胞谱系大科学研究设施，自主部署项目，2025-10-1至2027-03-31，100万元，在研，主持

3） 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 2024-01-01 至 2027-12-31, 50万元, 在研, 主持

4） 国家自然科学基金委员会, 青年项目, 2020-01-01 至 2022-12-31, 25万元, 结题, 主持

5） 人力资源和社会保障部、全国博士后管委会, 博新计划, 2018-10 至 2020-09, 60万元, 结题, 主持

6） 中国博士后科学基金会, 面上项目（一等）, 2019-01 至 2020-12, 8万元, 结题, 主持

1) Da Lin^#; Ping Hong^#; Siheng Zhang; Weize Xu; Muhammad Jamal; Keji Yan; Yingying Lei; Liang Li; Yijun Ruan; Zhen F. Fu; Guoliang Li^*; Gang Cao^*; Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture, Nature Genetics, 2018, 50(5): 754-763 (亮点文章，Nature genetics同期评论文章专题报道)

2) Xiaochen Gao^#; Xinyu Li^#; Weize Xu; Ming Jiao; Yu Guo; Jiajia Wang; Weihao Wang; Jiling Feng; Qianqian Guo; Chengchao Wu; Taiyu Zhang; Yuqin Yang^*; Da Lin^*; Identification of multiple genomic alterations and prediction of neoantigens from circulating tumor cells at the single-cell level, Nature Communications, 2025, 16(1):6901

3) Da Lin^#*; Yanyan Zou^#; Xinyu Li; Jinyue Wang; Qin Xiao; Xiaochen Gao; Fei Lin; Ningyuan Zhang; Ming Jiao; Yu Guo; Zhaowei Teng; Shiyi Li; Yongchang Wei; Fuling Zhou; Rong Yin; Siheng Zhang; Lingyu Xing; Weize Xu; Xiaofeng Wu; Bing Yang; Ke Xiao; Chengchao Wu; Yingfeng Tao; Xiaoqing Yang; Jing Zhang; Sheng Hu; Shuang Dong; Xiaoyu Li; Shengwei Ye; Zhidan Hong; Yihang Pan; Yuqin Yang; Haixiang Sun^*; Gang Cao^*; MGA-seq: robust identification of extrachromosomal DNA and genetic variants using multiple genetic abnormality sequencing, Genome Biology, 2023,24(1) :247

4) Da Lin^#; Weize Xu^#; Ping Hong^#; Chengchao Wu; Zhihui Zhang; Siheng Zhang; Lingyu Xing; Bing Yang; Wei Zhou; Qin Xiao; Jinyue Wang; Cong Wang; Yu He; Xi Chen; Xiaojian Cao; Jiangwei Man; Aikebaier Reheman; Xiaofeng Wu; Xingjie Hao; Zhe Hu; Chunli Chen; Zimeng Cao; Rong Yin; Zhen F. Fu; Rong Zhou; Zhaowei Teng; Guoliang Li^*; Gang Cao^*; Decoding the spatial chromatin organization and dynamic epigenetic landscapes of macrophage cells during differentiation and immune activation, Nature Communications, 2022, 13(1): 5857

5) Zhihui Zhang^#; Chengchao Wu; Khaista Rahman; Weize Xu; Guoliang Li^*; Da Lin^*; Gang Cao^*; Robust capturing chromosome conformation using the DLO Hi-C 2.0 method, Journal of Genetics and Genomics, 2020, 47(10): 655-658

6) Da Lin; Siheng Zhang; Zhihui Zhang; Weize Xu; Ping Hong; Guoliang Li; Gang Cao; The “toolbox” for chromatin conformation capture, SCIENTIA SINICA Vitae, 2020, 50(5): 497-505

7) Jun Min^#; Da Lin^#; Qingye Zhang; Jibing Zhang; Ziniu Yu; Structure-based virtual screening of novel inhibitors of the uridyltransferase activity of Xanthomonas oryzae pv. oryzae GlmU, European Journal of Medicinal Chemistry, 2012, 53: 150-158