中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员/博士生导师。主要研究方向:1)干细胞多能性维持的分子机制及命运调控;2)基于多能干细胞的疾病动物模型建立。3)异种嵌合的分子、细胞和发育基础。4)细胞命运转变的多维数据分析与数学建模。主要学术贡献包括;1)发现cJun/AP1是体细胞重编程的障碍(Nature Cell Biology,2015; Cell Stem Cell,2017;Cell Mol Life Sci,2021; Nature Communications, 2022)。2)建立了新型转录因子及化合物诱导多能干细胞体系(Cell Stem Cell,2018;Cell Reports, 2019) 。3)建立了新型的化合物诱导小鼠PNT转变体系并揭示其中的分子机制(Nature Cell Biology,2020;Nature Ccommunications,2022)。以(共)第一或(共)通讯作者在Nature Cell Biology, Cell Stem Cell, Cell Research, Nat Communications,Cell Reports 等SCI杂志上发表文章18篇。申请发明专利14项。
科研与学术工作经历
2018-至今 中国科学院广州生物医药与健康研究院 研究员/博士生导师
2013-2017 中国科学院广州生物医药与健康研究院 副研究员
2012-2013 中国科学院广州生物医药与健康研究院 助理研究员
教育经历(时间倒序)
2007-2012 中国科学院广州生物医药与健康研究院,生化和分子生物学,博士
2003-2007 湖北大学, 生命科学学院, 生物科学,学士
体细胞重编程;多能性和全能性;早期胚胎发育;异种嵌合;生物进化;数学建模
具体包括如下研究方向:
(1)iPSC(诱导多能干细胞)、PNT(干细胞始发态-基态转变)等细胞命运操控技术与机制。
(2)生殖细胞的体外诱导与生殖发育;
(3)人类疾病的动物建模;
(4)哺乳动物异种嵌合的分子、细胞和发育基础;
(5)细胞命运调控的数学建模。
国家优秀青年科学基金项目(2020年),项目负责人。
国家自然科学基金面上项目(2020年),项目负责人。
国家科技部重点研发计划(2019年),项目负责人。
国家青年科学基金项目(2015年),项目负责人。
广州市高层次人才“杰出专家”(2022年)
国家自然科学基金优秀青年(2020年)
国家重点研发计划首席科学家(2019年)
中国新锐科技人物(2018年)
中国科学院杰出科技成就奖(2017年,主要完成者)
中国科学院广州分院优秀青年科技工作者(2016年)
广东省科学技术一等奖(2015年)
广州市科学技术一等奖(2015年)
广州市珠江科技新星(2014年)
(一作及通讯作者)
1. Liu Y#, Zhang S#, Zou G, An J, Li Y, Lin D, Wang D, Li Y, Chen J, Feng T, Li H, Chen Y, Zhang M, Kumar M, Wang L*, Hou R*, Liu J* (2024). Generation and characterization of giant panda induced pluripotent stem cells. Sci Adv. 10(38):eadn7724. doi: 10.1126/sciadv.adn7724. Epub 2024 Sep 20.
2. Guan, T#., J. Guo#, R. Lin, J. Liu, R. Luo, Z. Zhang*, D. Pei* and J. Liu* (2024). "Single-cell analysis of preimplantation embryonic development in guinea pigs." BMC Genomics 25(1): 911.
3. Li, C., X. Xu, S. Chen, A. Xu, T. Guan, H. Wu*, D. Pei* and J. Liu* (2024). Epigenetic reshaping through damage: promoting cell fate transition by BrdU and IdU incorporation. Cell Biosci, 14(1): 9.
4. Wu, H., Li, C., Masood, M., Zhang, Z., Ester, G., Alvaro, C., Zou, G., Xu, X., Wang, L., Zhao, G., Yu, S., Zhu, P.,Wang, B., Qin, D., and J. Liu* (2022). Static Magnetic Fields Regulate T-Type Calcium Ion Channels and Mediate Mesenchymal Stem Cells Proliferation. cells, 11(15):2460.
5. Lin, R. #, Z. Zhai#, J. Kuang#, C. Wu, Y. Yao, R. Shi, J. He, S. Xu, P. Li, Y. Fan, W. Li, Z. Wu, X. Li, J. Ming, J. Guo, B. Wang, D. Li, S. Cao, X. Zhang, Y. Li, D. Pei* & J. Liu* (2022) H3K27ac mediated SS18/BAFs relocation regulates JUN induced pluripotent-somatic transition. Cell Biosci, 12, 89.
6. Yu, S. #, C. Zhou#, J. He#, Z. Yao, X. Huang, B. Rong, H. Zhu, S. Wang, S. Chen, X. Wang, B. Cai, G. Zhao, Y. Chen, L. Xiao, H. Liu, Y. Qin, J. Guo, H. Wu, Z. Zhang, M. Zhang, X. Zhao, F. Lan, Y. Wang, J. Chen, S. Cao*, D. Pei* & J. Liu* (2022) BMP4 drives primed to naive transition through PGC-like state. Nat Commun, 13, 2756.
7. Kuang, J. #, Z. Zhai#, P. Li, R. Shi, W. Guo, Y. Yao, J. Guo, G. Zhao, J. He, S. Xu, C. Wu, S. Yu, C. Zhou, L. Wu, Y. Qin, B. Cai, W. Li, Z. Wu, X. Li, S. Chu, T. Yang, B. Wang, S. Cao, D. Li, X. Zhang, J. Chen, J. Liu*& D. Pei* (2021) SS18 regulates pluripotent-somatic transition through phase separation. Nat Commun, 12, 4090.
8. Fu, M. #, H. Chen#, Z. Cai, Y. Yang, Z. Feng, M. Zeng, L. Chen, Y. Qin, B. Cai, P. Zhu, C. Zhou, S. Yu, J. Guo, J. Liu*, S. Cao* & D. Pei* (2021) Forkhead box family transcription factors as versatile regulators for cellular reprogramming to pluripotency. Cell Regen, 2;10(1):17
9. Liu, Y., J. He, R. Chen, H. Liu, J. Chen, Y. Liu, B. Wang, L. Guo, D. Pei, J. Wang, J. Liu *& J. Chen* (2021) AP-1 activity is a major barrier of human somatic cell reprogramming. Cell Mol Life Sci. 78(15):5847-5863.
10. Yu, S. #, C. Zhou#, S. Cao#, J. He, B. Cai, K. Wu, Y. Qin, X. Huang, L. Xiao, J. Ye, S. Xu, W. Xie, J. Kuang, S. Chu, J. Guo, H. Liu, W. Pang, L. Guo, M. Zeng, X. Wang, R. Luo, C. Li, G. Zhao, B. Wang, L. Wu, J. Chen, J. Liu* & D. Pei * (2020) BMP4 resets mouse epiblast stem cells to naive pluripotency through ZBTB7A/B-mediated chromatin remodelling. Nat Cell Biol, 22, 651-662.
11. Wu, L., G. Zhao, S. Xu, J. Kuang, J. Min, G. Wu, T. Wang, B. Wang, P. Zhu, D. Pei* & J. Liu* (2020) The nuclear factor CECR2 promotes somatic cell reprogramming by reorganizing the chromatin structure. J Biol Chem. 296:100022.
12. Wang, B. #, L. Wu#, D. Li#, Y. Liu, J. Guo, C. Li, Y. Yao, Y. Wang, G. Zhao, X. Wang, M. Fu, H. Liu, S. Cao, C. Wu, S. Yu, C. Zhou, Y. Qin, J. Kuang, J. Ming, S. Chu, X. Yang, P. Zhu, G. Pan, J. Chen, J. Liu* & D. Pei* (2019) Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic Fibroblasts by Jdp2-Jhdm1b-Mkk6-Glis1-Nanog-Essrb-Sall4. Cell Rep, 27, 3473-3485 e5.
13. Cao, S. #, S. Yu#, D. Li#, J. Ye, X. Yang, C. Li, X. Wang, Y. Mai, Y. Qin, J. Wu, J. He, C. Zhou, H. Liu, B. Zhao, X. Shu, C. Wu, R. Chen, W. Chan, G. Pan, J. Chen, J. Liu* & D. Pei* (2018) Chromatin Accessibility Dynamics during Chemical Induction of Pluripotency. Cell Stem Cell, 22, 529-542 e5.
14. Cao, S. #, S. Yu, Y. Chen, X. Wang, C. Zhou, Y. Liu, J. Kuang, H. Liu, D. Li, J. Ye, Y. Qin, S. Chu, L. Wu, L. Guo, Y. Li, X. Shu, J. Chen, J. Liu* & D. Pei * (2017) Chemical reprogramming of mouse embryonic and adult fibroblast into endoderm lineage. J Biol Chem, 292, 19122-19132.
15. Li, D. #, J. Liu#, X. Yang#, C. Zhou, J. Guo, C. Wu, Y. Qin, L. Guo, J. He, S. Yu, H. Liu, X. Wang, F. Wu, J. Kuang, A. P. Hutchins*, J. Chen* & D. Pei* (2017) Chromatin Accessibility Dynamics during iPSC Reprogramming. Cell Stem Cell, 21, 819-833 e6.
16. Liu, J., Q. Han, T. Peng, M. Peng, B. Wei, D. Li, X. Wang, S. Yu, J. Yang, S. Cao, K. Huang, A. P. Hutchins, H. Liu, J. Kuang, Z. Zhou, J. Chen, H. Wu, L. Guo, Y. Chen, Y. Chen, X. Li, H. Wu, B. Liao, W. He, H. Song, H. Yao, G. Pan, J. Chen* & D. Pei* (2015) The oncogene c-Jun impedes somatic cell reprogramming. Nat Cell Biol, 17, 856-67.
17. Ouyang, J. #, W. Yu#, J. Liu#, N. Zhang, L. Florens, J. Chen, H. Liu, M. Washburn, D. Pei *& T. Xie* (2015) Cyclin-dependent kinase-mediated Sox2 phosphorylation enhances the ability of Sox2 to establish the pluripotent state. J Biol Chem, 290, 22782-94.
18. Chen, J. #, J. Liu#, Y. Chen, J. Yang, J. Chen, H. Liu, X. Zhao, K. Mo, H. Song, L. Guo, S. Chu, D. Wang, K. Ding & D. Pei* (2011a) Rational optimization of reprogramming culture conditions for the generation of induced pluripotent stem cells with ultra-high efficiency and fast kinetics. Cell Res, 21, 884-94.
19. Chen, J. #, J. Liu#, Q. Han, D. Qin, J. Xu, Y. Chen, J. Yang, H. Song, D. Yang, M. Peng, W. He, R. Li, H. Wang, Y. Gan, K. Ding, L. Zeng, L. Lai, M. A. Esteban & D. Pei* (2010) Towards an optimized culture medium for the generation of mouse induced pluripotent stem cells. J Biol Chem, 285, 31066-72.
20. Chen, J#., J. Liu#, J. Yang, Y. Chen, J. Chen, S. Ni, H. Song, L. Zeng, K. Ding & D. Pei* (2011b) BMPs functionally replace Klf4 and support efficient reprogramming of mouse fibroblasts by Oct4 alone. Cell Res, 21, 205-12.
专利
1. 豚鼠多能干细胞及其制备方法,申请号:202311874002.9,申请日:2023.12.30,申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:刘晶、郭婧、罗蓉苹、林润霞;
2. 诱导体细胞重编程的因子及诱导体细胞重编程的方法,申请号:202311831064.1,申请日:2023.12.27,申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:刘晶、肖立展、黄子芬、王鲁勤、茆慧萍;
3. 一种诱导多能干细胞由始发态进入基台的方法及培养基体系,申请号:202410353071.3,申请日:2024.03.26,申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:刘晶、王鲁勤、邹高阳、肖立展、茆慧萍;
4. 一种制备大熊猫诱导性多能干细胞的培养基体系及方法,申请号:202410353067.7,申请日:2024.03.26,申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院,成都大熊猫繁育研究基地;发明人:刘晶、张世豪、刘玉良、邹高阳、王鲁勤、安俊辉、李媛;
5. 诱导体细胞重编程的因子以及使用该因子诱导体细胞重编程的方法;专利号: ZL 201910327535.2;申请日:2019.04.23;授权公告日:2023.11.24;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;刘晶;王波;吴琳琳;
6. 诱导体细胞重编程的因子以及使用该因子诱导体细胞重编程的方法;专利号:ZL 201910188173.3申请日:2019.03.13;授权公告日:2023.11.07;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;刘晶;王波;吴琳琳;刘雨婷;
7. 一种用于化学诱导多能性干细胞生成的培养体系以及使用该培养体系的化学重编程方法。申请号:201810170553.X;申请日:2018.03.01;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院 ;发明人:裴端卿;曹尚涛;刘晶;余胜勇;陈捷凯;叶晶;李东伟;
8. 一种用于制备内胚层细胞系的培养体系以及制备内胚层细胞系的方法;申请号:201710814001.3;申请日:2017.09.11;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;刘晶;曹尚涛;余胜勇;陈捷凯;
9. 一种制备诱导多能性干细胞的方法以及该方法中所使用的组合物及其应用;专利号:ZL 201310574447.5申请日:2013.11.15;授权公告日:2019.10.01;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;刘晶;陈捷凯;彭梅秀;
10. c-Jun的N端缺失诱导多能性干细胞的方法和应用;专利号:ZL 201210324576.4;申请日:2012.09.04;授权公告日:2013.10.16;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;韩庆凯;刘晶;陈捷凯;韦备;彭梅秀;
11. c-Jun的截短型维持胚胎干细胞多能性的方法和应用;专利号:ZL 201210324215.X;申请日:2012.09.04;授权公告日:2013.12.04 ;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;刘晶;韩庆凯;陈捷凯;韦备;彭梅秀;
12. 一种培养基添加剂及其应用;专利号:ZL 201010167062.3;申请日:2010.04.30;授权公告日:2015.06.03;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;陈捷凯;刘晶;
13. 骨形成蛋白在诱导诱导式多能性干细胞过程中的应用;专利号: ZL 201010510485.0;申请日:2010.10.18 ;授权公告日:2014.05.14;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;陈捷凯;刘晶;
14. 诱导多能性干细胞快速高效产生的新型无血清培养基以及使用其的方法;专利号:ZL200910038883.4;申请日:2009.04.23 ;授权公告日:2012.02.29;申请(专利权)人:中国科学院广州生物医药与健康研究院;发明人:裴端卿;陈捷凯;刘晶;