现任中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员、博士生导师。2012年博士毕业于中山大学中山医学院病原生物学专业(导师余新炳教授),2012年获得医学博士学位后赴美留学,2012年至2017年在美国芝加哥大学医学院从事博士后研究(导师Tao Pan教授);2017年作为独立PI获得美国NIH K award,同年晋升为芝加哥大学医学院青年研究员;2019年2月作为华南师范大学海外高层次人才,聘为教授引进到生命科学学院工作; 2019年10月起任华南师范大学生命科学学院党支部书记、党委委员、科研副院长;2024年2月引进到中国科学院广州生物医药与健康研究院工作。
近年来主要从事病原微生物与宿主互作表观遗传机制研究,科研成果发表SCI论文60多篇,累计影响因子超过300分,其中以第一作者/通讯作者(含共同)在Nature Chemical Biology, Genome Research, Cell Research, Cell Reports, Advanced Science, Genome Biology, PLOS Genetics等国际权威期刊发表SCI论文近30篇。论文成果被Nature Reviews Genetics等杂志引用超过2000次,H-index 30。科研成果获得广东省科学技术二等奖(2018年)、美国NIH K award(2017年)、英国Odile Bain Memorial Prize虫媒病研究奖(2015年,全球每年2名获奖者)、广东省南粤优秀论文奖(2012年)、中山大学光华教育奖(2011年)等奖励。作为项目负责人主持美国NIH K award、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年基金、广东省自然科学基金面上项目、广州市科技计划项目等多个科研项目,作为课题骨干曾参与国家973计划、国家863计划、美国NIH主任基金等中美重大科研项目。
现任国家自然科学基金项目评审专家、教育部长江学者项目评审专家、广东省科技厅项目评审专家、粤港澳肠道微生态学术联盟理事、中国医药教育协会微生态与健康专业委员会委员、中国昆虫学会微生组学专业委员会委员、中山大学肠道微生态教育部重点实验室学术委员会委员;担任Clinical Microbiology Reviews、Nature Communications等多个学术期刊评审。
1.人体肠道微生物与宿主互作机制
肠道微生物对人体和动物健康非常重要,是近年来的研究热点。肠道微生态对于维持宿主代谢和免疫功能具有重要意义,但肠道微生态与宿主之间的互作机制需要不断深入研究。该方向主要探讨肠道微生物及其代谢物调控宿主细胞RNA表观遗传和基因表达机制。
2.人体病原微生物与宿主互作机制
病原微生物严重威胁人体健康和公共卫生,且大量病原微生物感染和致病机制尚不清楚。该方向主要探讨重要病原微生物感染宿主细胞过程中的耐药机制、宿主细胞免疫功能重塑机制、宿主细胞基因表达谱系解析等生命科学领域的重要科学问题。
3.感染性疾病疫苗研发和药物研发
疫苗和药物是防治传染病的重要手段,但是目前大量病原微生物和威胁生物安全的病原体尚无疫苗和靶向药物。该方向主要以致癌性病原微生物(幽门螺杆菌、具核梭杆菌、消化链球菌等)为研究对象,鉴定病原体感染、复制和毒力关键因子,研发RNA疫苗和RNA药物。
1.国家自然科学基金面上项目(2021-2024),肠道菌群调控宿主mRNA甲基化修饰机制研究,项目负责人
2.国家自然科学基金青年项目(2020-2022),登革热媒介白纹伊蚊肠道菌群调控的tiRNA鉴定及其功能研究,项目负责人
3.广东省科技厅自然科学基金项目(2021-2023),肠道菌群调控果蝇宿主mRNA m6A甲基化修饰机制研究,项目负责人
4.广东省科技厅自然科学基金项目(2022-2024),肠道菌群代谢物叶酸调控宿主RNA修饰和发育机制研究,项目负责人
5.广州市科技计划科技菁英“领航”计划项目(2024-2027),肠道微生物与宿主互作的表观遗传机制研究,项目负责人
6.广州市科技计划基础研究项目(2020-2022),肠道共生菌协同蚊媒病毒调控宿主RNA甲基化分子机制研究,项目负责人
7.美国NIH Research Scientist K Award (2017-2022),Translational regulation through gut microbiome-derived queuosine tRNA modification,项目负责人
8.美国NIH Director's Pioneer Award,Functional genomics of RNA and epigenetics,项目参与人
广东省科学技术进步二等奖(2018)
美国NIH K Award (2017)
英国Odile Bain Memorial Prize (2015)
南粤科技创新优秀学位论文奖(2012)
代表性论文(#第一作者,*通讯作者):
1. Xu Z#, Zheng X#, Fan J#, Jiao Y, Huang S, Xie Y, Xu S, Lu Y, Liu A, Liu R, Yang Y, Luo GZ, Pan T, Wang X*. Microbiome-induced reprogramming in post-transcriptional landscape using Nanopore direct RNA sequencing. Cell Reports, 2024,43(10):114798.
2. Yang M#, Zheng X#, Fan J#, Cheng W#, Yan TM, Lai Y, Zhang N, Lu Y, Qi J, Huo Z, Xu Z, Huang J, Jiao Y, Liu B, Pang R, Zhong X, Huang S, Luo GZ, Lee G, Jobin C, Eren AM, Chang EB, Wei H*, Pan T*, Wang X*. Antibiotic-induced gut microbiota dysbiosis modulates host transcriptome and m6A epitranscriptome via bile acid metabolism. Advanced Science. 2024, 11(28):e2307981.
3. Huang J#, Chen W#, Zhou F, Pang Z, Wang L, Pan T, Wang X*. Tissue-specific reprogramming of host tRNA transcriptome by the microbiome. Genome Research. 2021, 31(6):947-957.
4. Wang X#, Li Y#, Chen W, Shi H, Eren AM, Morozov A, He C, Luo GZ*, Pan T*. Transcriptome-wide reprogramming of N6-methyladenosine modification by the mouse microbiome. Cell Research. 2019, 29(2):167-170.
5. Ma H#, Wang X#, Cai J#, Dai Q, Natchiar SK, Lv R, Chen K, Lu Z, Chen H, Shi YG, Lan F, Fan J, Klaholz BP, Pan T*, Shi Y*, He C*. N6-methyladenosine methyltransferase ZCCHC4 mediates ribosomal RNA methylation. Nature Chemical Biology. 2019, 15(1):88-94.
6. Wang X, Chen W, Huang Y, Sun J, Men J, Liu H, Luo F, Guo L, Lv X, Deng C, Zhou C, Fan Y, Li X, Huang L, Hu Y, Liang C, Hu X, Xu J, Yu X*. The draft genome of the carcinogenic human liver fluke Clonorchis sinensis. Genome Biology. 2011, 12(10):R107.
7. Wang X*, Pan T*. Methionine mistranslation bypasses the restraint of the genetic code to generate mutant proteins with distinct activities. PLOS Genetics. 2015, 11(12):e1005745.
8. Liu X#, Yang M#, Liu R, Zhou F, Zhu H*, Wang X*. The impact of Parkinson's disease-associated gut microbiota on the transcriptome in Drosophila. Microbiology Spectrum. 2023 Sep 27;e0017623.
9. Huang J#, Zhou F#, Zhou H, Zheng X, Huo Z, Yang M, Xu Z, Liu R, Wang L, Wang X*. Systematic assessment of transcriptomic and metabolic reprogramming by blue light exposure coupled with aging. PNAS Nexus. 2023 Dec 5;2(12):pgad390.
10. Wang X*, Matuszek Z, Huang Y, Parisien M, Dai Q, Clark W, Schwartz MH, Pan T*. Queuosine modification protects cognate tRNAs against ribonuclease cleavage. RNA. 2018, (10):1305-1313.