2018年博士毕业于华中农业大学农业微生物国家重点实验室，同年入选第三届中国博士后创新人才支持计划。2022年完成国家重点实验室博士后工作，入职上海交通大学医学院，担任副研究员、课题组长（PI）。2025年3月加入中国科学院广州生物医药与健康研究院，担任谱系技术与装备研究中心基因组多维技术研究组组长（PI）、研究员。

1）主要研究方向：

肿瘤基因组学、三维基因组学、基因组结构变异与转录调控、单细胞基因多维组学技术开发。

2）课题组简介：

课题组近年来一直围绕基因组学进行新技术开发、基础研究、应用转化工作，开发了一批具有自主知识产权的多维染色质构象及结构变异捕获新方法，如针对单细胞的基因组异常与三维结构共检测技术Uni-C(Nature Communications，2025，小修修回），专用于肿瘤及遗传病基因组异常筛查的MGA-Seq（Genome Biology，2023），高通量单细胞三维结构捕获技术sciDLO Hi-C（Nature Communications，2022），以及针对大量细胞高分辨率三维结构捕获的DLO Hi-C（Nature Genetics，2018）。这些新方法大幅降低了研究成本，提高了解析精度，其中DLO Hi-C被Nature Genetics专文评述为“优雅巧妙的文库构建策略”，并被Nature，Nature Genetics等经典期刊广泛引用。

利用该系列技术，我们鉴定了肿瘤及遗传性疾病中多种新型基因组结构变异并进行了新抗原预测，绘制了染色体外DNA（Extrachromosomal DNA,ecDNA）空间调控网络，解析了免疫细胞发育及感染免疫过程中的染色质重塑与表观修饰重编程，提出了染色质有序性的概念，并结合GWAS（Genome-Wide Association Studies）数据拓展了感染性疾病易感基因，挖掘了新的治疗靶点和药物。

1） 国家自然科学基金委员会,面上项目,32370685,基于肿瘤基因组三维结构特征开发群体及单细胞ecDNA检测方法并探究其突变规律及调控机制,2024-01-01 至 2027-12-31,50万元,在研,主持

2） 国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目,31900432,开发单细胞DLO Hi-C技术并解析衰老过程中海马-内嗅皮层神经环路基因组三维构象动态变化,2020-01-01 至 2022-12-31,25万元,结题,主持

3） 人力资源和社会保障部、全国博士后管委会,博士后创新人才支持计划,BX20180113,利用单细胞DLO Hi-C技术解析结核分枝杆菌潜伏感染后宿主基因组表观修饰的变化及挖掘结核易感基因,2018-10 至 2020-09,60万元,结题,主持

4） 中国博士后科学基金会,面上项目（一等）,2018M640710,结核分枝杆菌感染诱发宿主基因组表观修饰变化的研究,2019-01 至 2020-12,8万元,结题,主持

1) Da Lin^#*;Yanyan Zou^#;Xinyu Li;Jinyue Wang;Qin Xiao;Xiaochen Gao;Fei Lin;Ningyuan Zhang;Ming Jiao;Yu Guo;Zhaowei Teng;Shiyi Li;Yongchang Wei;Fuling Zhou;Rong Yin;Siheng Zhang;Lingyu Xing;Weize Xu;Xiaofeng Wu;Bing Yang;Ke Xiao;Chengchao Wu;Yingfeng Tao;Xiaoqing Yang;Jing Zhang;Sheng Hu;Shuang Dong;Xiaoyu Li;Shengwei Ye;Zhidan Hong;Yihang Pan;Yuqin Yang;Haixiang Sun^*;Gang Cao^*;MGA-seq: robust identification of extrachromosomal DNA and genetic variants using multiple genetic abnormality sequencing,Genome Biology,2023,24(1)

2) Da Lin^#;Weize Xu^#;Ping Hong^#;Chengchao Wu;Zhihui Zhang;Siheng Zhang;Lingyu Xing;Bing Yang;Wei Zhou;Qin Xiao;Jinyue Wang;Cong Wang;Yu He;Xi Chen;Xiaojian Cao;Jiangwei Man;Aikebaier Reheman;Xiaofeng Wu;Xingjie Hao;Zhe Hu;Chunli Chen;Zimeng Cao;Rong Yin;Zhen F. Fu;Rong Zhou;Zhaowei Teng;Guoliang Li^*;Gang Cao^*;Decoding the spatial chromatin organization and dynamic epigenetic landscapes of macrophage cells during differentiation and immune activation,Nature Communications,2022,13(1):5857

3) Da Lin^#;Ping Hong^#;Siheng Zhang;Weize Xu;Muhammad Jamal;Keji Yan;Yingying Lei;Liang Li;Yijun Ruan;Zhen F. Fu;Guoliang Li^*;Gang Cao^*;Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture,Nature Genetics,2018,50(5):754-763 (亮点文章，Nature genetics同期评论文章专题报道)

4) Xiaochen Gao^#;Xinyu Li^#;Weize Xu;Ming Jiao;Yu Guo;Jiajia Wang;Weihao Wang;Jiling Feng;Qianqian Guo;Chengchao Wu;Taiyu Zhang;Yuqin Yang^*;Da Lin^*;Identification of multiple genomic alterations and prediction of neoantigens from circulating tumor cells at the single-cell level,Nature Communications,2025 (小修修回)

5) Zhihui Zhang^#;Chengchao Wu;Khaista Rahman;Weize Xu;Guoliang Li^*;Da Lin^*;Gang Cao^*;Robust capturing chromosome conformation using the DLO Hi-C 2.0 method,Journal of Genetics and Genomics,2020,47(10):655-658

6) Da Lin;Siheng Zhang;Zhihui Zhang;Weize Xu;Ping Hong;Guoliang Li;Gang Cao;The “toolbox” for chromatin conformation capture,SCIENTIA SINICA Vitae,2020,50(5):497-505

7) Jun Min^#;Da Lin^#;Qingye Zhang;Jibing Zhang;Ziniu Yu;Structure-based virtual screening of novel inhibitors of the uridyltransferase activity of Xanthomonas oryzae pv. oryzae GlmU,European Journal of Medicinal Chemistry,2012,53: 150-158